Profilerで「WaitForTargetFPS」が大きい。これは問題か？

全く問題ありません。これはCPUが「目標のフレームレート（60fpsなど）になるまで、余った時間をわざと待機している」だけの時間です。

デバイスが優秀で処理が早く終わったため、次に画面を更新するタイミングまで「休憩」している証拠だからです。

この項目が高い場合はゲームが快適に動いている証拠です。逆にこの項目がなくなり、Camera.Render や 自分の書いたスクリプト（Update等）の占める割合が大きくなっている時が、最適化が必要なサインです。