「MissingReferenceException」が出た場合は？

一度存在していたオブジェクトが、破壊（Destroy）された後に操作されようとした時に出ます（例：倒した敵の座標を追いかけようとした）。

Unityのオブジェクトは Destroy されるとメモリ上から消えますが、そのオブジェクトを記憶していた変数（参照）は残っているため、そこへアクセスすると エラーになります。

アクセスする前に if (enemy != null )のように生存確認（null チェック）を行うか、 Destroy した瞬間にその変数へ意図的に nullを代入する処理を追加してください。