「Assets/… is not allowed to be modified」という警告の意味は？

Package Manager経由で入れた読み取り専用ファイルのコードを直接編集しようとしています。

パッケージ内の元ファイルはアップデート時に上書きされるため、保護されているからです。

カスタマイズしたい場合は、該当スクリプトをコピーして自分の Assets/Scripts フォルダ内に配置してから編集・使用してください。