「Cannot destroy Transform component.」というエラーが出た。

Transform コンポーネントだけを単体で削除（Destroy）しようとしました。

Transformは全GameObjectに必須であり、切り離すことが許されていない仕様のためです。

そのオブジェクト自体を消したい場合は Destroy(gameObject); と記述してください。