Prefabを変更したら全インスタンスに反映させる方法は？

Hierarchy上にあるPrefabのクローンを編集した後、Inspectorの右上にある「Overrides」を押し、「Apply All」を実行します。

すると、大元の設計図と、シーン内にある他の全てのクローンに変更が反映されます。